Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BICD1Q96G01 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms