Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGF29Q96ES7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGF29Q96ES7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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