Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL39LQ96EH5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms