Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTERF3Q96E29 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms