Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms