Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MSI2Q96DH6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSI2Q96DH6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms