Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPTNQ96CV9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms