Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EAF2Q96CJ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EAF2Q96CJ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms