Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RUNDC1Q96C34 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUNDC1Q96C34 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms