Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYTL4Q96C24 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYTL4Q96C24 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms