Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG2BQ96BY7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG2BQ96BY7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms