Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD2Q96BF3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMIGD2Q96BF3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms