Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VOPP1Q96AW1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms