Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VTI1AQ96AJ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VTI1AQ96AJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms