Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-CQ95604 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms