Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFRSF25Q93038 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF25Q93038 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms