Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDAQ92838 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDAQ92838 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDAQ92838 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDAQ92838 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDAQ92838 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms