Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF4BQ92750 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF4BQ92750 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms