Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms