Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms