Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX29Q8TEQ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX29Q8TEQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms