Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATJQ8NI35 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATJQ8NI35 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms