Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms