Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms