Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L2Q8NAA4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms