Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf29Q8N999 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf29Q8N999 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms