Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8N8P6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N8P6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N8P6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N8P6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N8P6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N8P6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N8P6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N8P6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms