Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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