Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAG2Q8N3U4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAG2Q8N3U4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms