Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C17orf53Q8N3J3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C17orf53Q8N3J3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms