Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPUSD2Q8IZ73 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms