Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC117Q8IWD4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms