Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXP4Q8IVH2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXP4Q8IVH2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms