Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC3FQ8IUX4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms