Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NME9Q86XW9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NME9Q86XW9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms