Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPBP1Q86WP2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBP1Q86WP2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms