Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRAPQ7Z569 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRAPQ7Z569 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms