Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT25Q7Z3Z0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT25Q7Z3Z0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms