Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSX7Q7RTT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms