Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTOP1Q7RTM1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP1Q7RTM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms