Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBR3Q6ZT12 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBR3Q6ZT12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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