Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP12Q6UXS9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CASP12Q6UXS9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms