Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCD3Q6STE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCD3Q6STE5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms