Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL35Q6PF15 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms