Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFWD3Q6PCD5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFWD3Q6PCD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms