Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNNM4Q6P4Q7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNNM4Q6P4Q7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNNM4Q6P4Q7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms