Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EDC4Q6P2E9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms