Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R18Q6NYC8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R18Q6NYC8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R18Q6NYC8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R18Q6NYC8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R18Q6NYC8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R18Q6NYC8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms