Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB12Q6NXP0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms