Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SWSAP1Q6NVH7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SWSAP1Q6NVH7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms